Powstało w 1985 r. z inicjatywy Oddziału Warszawskiego PTF i PZF "Cefarm". Pierwszą siedzibą była kamienica przy Marszałkowskiej 72. Obecnie Muzeum mieści się przy Skierniewickiej 16/20.
Kilka lat temu Labofarm wyznaczył sobie misję upowszechniania fitoterapii w profilaktyce i leczeniu powszechnych schorzeń. Misja ta realizowana jest na różnych płaszczyznach, jednak doświadczenia ostatnich lat wskazują, iż coraz większego znaczenia nabierają działania przedstawicielskie
15 listopada Centrum Fitoterapii zorganizowało forum naukowe Fitoterapia - osiągnięcia i poszukiwania. Było to pierwsze z cyklu zaplanowanych spotkań, które służyć mają integracji środowiska lekarskiego, farmaceutycznego, przedstawicieli instytucji naukowych i państwowych oraz producentów i dystrybutorów - wokół aktualnych zagadnień ziołolecznictwa w Polsce i na świecie.
27 i 28 września 2002 obradował IX Ogólnopolski Sejmik Zielarski. Miał on szczególny charakter z dwu powodów: odbywał się po kilkuletniej przerwie i po raz pierwszy poza Lublinem - w poznańskim Ośrodku Nauki Polskiej Akademii Nauk przy ul. Wieniawskiego 17.
Od początku istnienia Centrum Fitoterapii wprowadziliśmy oparty na metodach statystycznych program monitorowania, który pozwala odpowiedzieć na pytanie, kto odwiedza Centrum, z jakimi dolegliwościami przychodzą pacjenci oraz z których leków ziołowych korzystają.
